致GBS空腸彎曲菌全基因組序列突變基因的初步分析.pdf

1、目的：從基因突變的角度出發(fā)，選擇三株本地區(qū)的具有致GBS致病性的空腸彎曲菌菌株，針對不同的基因片段，與NCTC11168序列比對分析，尋找基因突變和變異與致病性的關系，及菌株的基因地域特點。
　　 方法：⑴選取分離自華北地區(qū)AMAN型GBS病人的C.jejuni菌株。血清分型為pennerO：19型，pennerO：2型，pennerO：5型。⑵應用Sequence Alignment軟件將pennerO：2、pennerO：5

2、、pennerO：19的全基因組序列與Genbank中NCTC11168序列比較，找出突變堿基。⑶查閱文獻中推測和已經確定的突變基因，找到此基因片段分別在pennerO：2、pennerO：5、pennerO：19中與NCTC11168序列比較的突變堿基。⑶分析菌株差異及基因突變的意義。
　　 結果：①與NCTC11168全基因組序列相比，lulei株有13183個堿基突變，qiaoyuntao株有3624個堿基突變，zhanx

3、ing株有16505個堿基突變。②從文獻中共找到137個推測的和已經確定的致GBS的突變基因片段。lulei株、qiaoyuntao株、zhanxing株在相同堿基位點核苷酸均突變的基因片段有22個，三株菌中任意兩株菌在相同的堿基位點產生核苷酸突變的基因片段共有50個，在同一堿基位點三株菌無相同的核苷酸突變的基因片段共40個，三株菌均無核苷酸突變的基因片段有25個。③文獻中已經確定的并經實驗證實致GBS突變基因有galE、neuB1、c

4、st-Ⅱ和waaF，經排序后推測較有意義的突變基因有20個，有突變意義的基因50個，突變意義較小的突變基因有40個，無突變意義的基因有23個。
　　 結論：從文獻中共找到137個推測的和已經確定的致GBS的突變基因片段。文獻中已經確定的并經實驗證實致GBS突變基因有galE、neuB1、cst-Ⅱ和waaF，經排序后推測較有意義的突變基因有20個，有突變意義的基因50個，突變意義較小的突變基因有40個，無突變意義的有23個。而n

5、euB1、cst-Ⅱ等基因在lulei株、qiaoyuntao株、zhanxing株均無突變，原因可能是本地致GBS的菌株無neuB1、cst-Ⅱ等的突變，考慮為本地菌株的特點，仍需要更多的本地菌株來驗證；或者空腸彎曲菌致GBS可能不是單一基因致病，而是多個基因共同作用的結果。這種出現(xiàn)在本地菌株間的相同突變可能使所編碼蛋白發(fā)生有意義的改變，影響到蛋白功能，成為本地菌株高致病性以及華北地區(qū)GBS高發(fā)的分子生物學基礎。總之本研究中的三株致A