碳青霉烯非敏感大腸埃希菌耐藥機(jī)制初步研究及分子流行病學(xué)調(diào)查.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、目的:了解我院2012年碳青霉烯非敏感大腸埃希菌(Carbapenem non-susceptible Escherichia coli,CNS E.coli)的耐藥情況,對(duì)碳青霉烯非敏感大腸埃希菌的耐藥機(jī)制作初步研究,并進(jìn)行分子流行病學(xué)調(diào)查。
  方法:收集我院2012年1月至2012年12月分離的碳青霉烯非敏感大腸埃希菌分離株,通過(guò)檢驗(yàn)科 LIS系統(tǒng)(Laboratory Information System,LIS)查詢(xún)菌株

2、信息,微量肉湯稀釋法檢測(cè)其對(duì)各類(lèi)抗生素的MIC值;通過(guò)PCR(Polymerase chain reaction)技術(shù)檢測(cè)菌株中的碳青霉烯酶基因blaSME、blaKPC、blaIMP、blaVIM、blaNDM-1、blaOXA-48,ESBLs基因 blaCTX-M、blaTEM、blaSHV,氟喹諾酮類(lèi)耐藥決定因子(Fluoroquinolones resistance determinants,QRDs)基因qnrA、qnrB、

3、qnrC、qnrD、qnrS、aac(6’)-Ib-cr,氨基糖苷類(lèi)耐藥決定因子(Aminoglycosides resistance determinants,ARDs)基因armA、rmtB、aac(6’)-Ib,整合子基因Intl1,以及外膜蛋白(Outer membrane proteins, OMPs)基因ompC、ompF,并將檢出的耐藥相關(guān)基因進(jìn)行測(cè)序;脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulse field gel electrophor

4、esis,PFGE)進(jìn)行分子流行病學(xué)的調(diào)查。
  結(jié)果:1.2012年1月至2012年12月,我院共檢出大腸埃希菌1585株,其中非重復(fù)的碳青霉烯非敏感大腸埃希菌30株,占1.89%。CNS E.coli主要分離自尿液標(biāo)本(13株,43.3%),病區(qū)來(lái)源主要為外科病房和重癥監(jiān)護(hù)室,依次為肝膽外科(6株,20.0%)、泌尿外科(5株,16.7%)、重癥監(jiān)護(hù)室(5株,16.7%)和胃腸外科(3株,10.0%);病人大多數(shù)為老年人,年齡

5、≧65周歲的為14人(46.7%),男性多于女性。
  2.藥敏試驗(yàn)結(jié)果顯示:CNS E.coli菌株中有30株(100.0%)對(duì)厄他培南(Ertapenem,ETP)表現(xiàn)為非敏感,11株(36.7%)對(duì)亞胺培南(Imipenem,IPM)非敏感,1株(3.3%)對(duì)美羅培南(Meropenem, MEM)非敏感。100.0%(30/30)的CNS E.coli對(duì)至少一種頭孢菌素類(lèi)抗生素耐藥。氟喹諾酮類(lèi)抗生素和氨基糖苷類(lèi)抗生素的耐藥

6、率分別為96.7%(29/30)和63.3%(19/30)。
  3.耐藥相關(guān)基因檢測(cè)結(jié)果顯示:有2株(6.7%)CNS E.coli攜帶碳青霉烯酶基因,且均為blaKPC-2;29株(96.7%)檢出的ESBLs基因:blaCTX-M(26/30,86.7%)、blaTEM(12/30,40.0%);20株(66.7%)檢出QRDs基因:qnrA(5/30,16.7%)、qnrB(7/30,23.3%)、aac(6’)-Ib-c

7、r(13/30,43.3%);11株(36.7%)檢出ARDs基因:,armA(1/30,3.3%)、rmtB(2/30,6.7%)、aac(6’)-Ib(11/30,36.7%),8株(26.7%)存在OMPs基因缺失:1株(3.3%)僅存在ompC基因缺失,5株(16.7%)僅存在ompF基因缺失,2株(6.7%)存在ompC、ompF基因同時(shí)缺失;整合子基因Intl1的檢出率為40.0%(12/30)。
  4.在2株碳青霉

8、烯酶基因陽(yáng)性的菌株中,ESBLs基因、QRDs基因、ARDs基因和Intl1基因的聯(lián)合表達(dá)率分別為100.0%、50.0%、50.0%和50.0%,膜孔蛋白基因缺失率為0.0%;29株ESBLs基因陽(yáng)性的菌株中,QRDs基因、ARDs基因和Intl1基因的聯(lián)合表達(dá)率分別為65.5%、37.9%和37.9%,膜孔蛋白基因缺失率為24.1%。我們首次報(bào)道了聯(lián)合表達(dá) blaKPC-2、blaCTX-M-14’、blaCTX-M-55’、bla

9、TEM、aac(6’)-Ib-cr、qnrB、aac(6’)-Ib和 rmtB的多重耐藥大腸埃希菌分離株(已發(fā)表于 Infection, Genetics and Evolution雜志)。
  5. PFGE結(jié)果顯示:30株CNS E.coli分屬于27個(gè)型別,提示我院CNS E.coli菌株呈現(xiàn)克隆多樣性,且這些菌株的流行并不是由克隆傳播導(dǎo)致的。
  結(jié)論:1. CNS E.coli菌株主要分離自尿液標(biāo)本,病區(qū)分布以外科

10、病房和重癥監(jiān)護(hù)室為主;我院CNS E.coli菌株主要對(duì)厄他培南非敏感,亞胺培南非敏感次之,美羅培南非敏感最少,且大部分菌株表現(xiàn)為多重耐藥。
  2.碳青霉烯酶基因并不是導(dǎo)致我院大腸埃希菌對(duì)碳青霉烯類(lèi)抗生素非敏感的主要原因,ESBLs基因聯(lián)合膜孔蛋白缺失可能是我院CNS E.coli產(chǎn)生的主要機(jī)制;多種耐藥基因的聯(lián)合表達(dá)可能會(huì)導(dǎo)致多重耐藥。
  3.我院的CNS E.coli菌株呈現(xiàn)克隆多樣性,其流行并不是由克隆傳播導(dǎo)致的。

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