14144.植物非生物逆境下mirna分子調控網絡數據庫的構建及其在茶樹中的應用

1、1分類號：單位代碼：10364密級：學號：S10090203498安徽農業(yè)大學安徽農業(yè)大學學位論文植物非生物逆境下植物非生物逆境下miRNA分子調控網絡數分子調控網絡數據庫的構建及據庫的構建及其在茶樹中的應用在茶樹中的應用AliteraturecurateddatabasefmiRNAmolecularregulationinplantresponsetoabioticstressapplicationinteaplant(Camell

2、iasinensis)研究生：盛亮指導教師：韋朝領教授合作指導教師：申請學位門類級別：農學碩士專業(yè)名稱：茶學研究方向：茶樹種質資源與生物技術所在學院：茶與食品科技學院答辯委員會主席：二零一三年六月I摘要MicrNA(miRNA)作為一類非常重要的基因表達調控因子而日益受到關注。盡管有關miRNA在植物各種非生物逆境脅迫中的具體調控作用報道較多，但是目前還沒有關于miRNA與非生物逆境脅迫的調控關系的數據庫，導致人們難以從整體上分析miR

3、NA與多種非生物逆境間的復雜調控途徑與作用方式；同時有關miRNA參與茶樹對非生物逆境響應機制的研究甚少。鑒于此，本研究利用文本挖掘方法構建一個miRNA參與調控植物非生物逆境的調控網絡數據庫，并對茶樹miRNA進行預測分析，結合降解組測序對參與茶樹非生物逆境的miRNA作用靶基因進行功能驗證。進而初步揭示miRNA在茶樹遭受非生物逆境時的調控作用機制。本研究主要結果如下：（1）收集了有關miRNA在植物非生物逆境下調控作用研究的相關文

4、獻近200篇，分析了來自33個植物物種的682個miRNA與35個非生物逆境產生的1038個調控關系。利用文本挖掘的方法，構建了植物非生物逆境下miRNA分子調控數據庫PASmiR。該數據庫提供了數據的收集，標準化數據以及miRNA逆境關系的搜索等功能；可供檢索的信息包括：物種名稱、miRNA名稱、逆境名稱、miRNA的表達特征、試驗方法、參考文獻和miRNA靶基因。用戶可能通過關鍵詞對數據庫搜索得到相關miRNA與逆境的關系。PASm

5、iR數據庫擁有2個免費的連接網址：:hi.ustc.:8080PASmiR:pasmir.ahau.:8080PASmiR（2）基于PASmiR數據庫，對測序獲得的43個茶樹保守的miRNA家族與非生物逆境的關系進行預測，結果表明，有31個保守miRNA家族與非生物逆境具有潛在的應答關系，其中25個參與低溫脅迫，26個參與干旱脅迫。（3）利用降解組測序共鑒定出miRNA作用的靶基因203個，其中與低溫脅迫的靶基因189個，與干旱脅迫的靶