中國漢族人白癜風(fēng)易感基因的定位研究.pdf

1、白癜風(fēng)(Vitiligo，OMIM：＃193200)是一種色素脫失性皮膚病，主要表現(xiàn)為皮肽、粘膜及毛發(fā)的黑素細(xì)胞選擇性減少或消失導(dǎo)致的白斑、灰／白發(fā)，其病因和發(fā)病機(jī)制尚不明了。目前已有以下學(xué)說：自身免疫學(xué)說、遺傳學(xué)說、黑素細(xì)胞自身破壞學(xué)說及生物化學(xué)學(xué)說等。而近年來，國內(nèi)外大量研究表明遺傳因素與白癜風(fēng)發(fā)病密切相關(guān)，很可能是一種多基因遺傳病，同時還發(fā)現(xiàn)其它各種學(xué)說均存在其遺傳學(xué)基礎(chǔ)。目前已有文獻(xiàn)報道白種人中的3個白癜風(fēng)易感位點一lp31(A

2、ISl)、7q(SIS2)和8p(AIS3)。 本研究首先利用分布在人類22條染色體上的382個微衛(wèi)星多態(tài)標(biāo)記對57個中國人尋常型白癜風(fēng)家系(每個家系至少有兩個同胞患病)進(jìn)行全基因組掃描及連鎖分析，初步鑒定有意義的易感基因位點。在此基礎(chǔ)上，再增加微衛(wèi)星標(biāo)記的密度和新增49個家系對以上支持連鎖的有意義的區(qū)域進(jìn)行精細(xì)定位，從而鑒定中國漢族尋常型白癜風(fēng)最主要的易感位點。 [初始的全基因掃描連鎖分析結(jié)果] 通過對57個白

3、癜風(fēng)核心家系進(jìn)行全基因組連鎖分析，我們分別鑒定出6個有意義的易感基因位點，分別位于1、4、6、14和22號染色體上。6號染色體6q24-q25區(qū)域是連鎖證據(jù)最強(qiáng)的位點(最大多點NPL值為3．05，最大多點隱性HLOD值為2．99)。4號染色體4q12-q21區(qū)域是連鎖證據(jù)位于第二強(qiáng)的位點(最大多點NPL值為2．94，最大多點隱性HLOD值為1．94)；緊跟其后的是6號染色體6p21．p22也存在連鎖證據(jù)(最大多點NPL值為2．67，最大

4、多點顯性HLOD值為2．26)。染色體1p36、14q12-q13和22q12的3個區(qū)域也存在連鎖證據(jù)，但是它們的連鎖信號較弱。在先前全基因組掃描的基礎(chǔ)上，我們通過增加微衛(wèi)星標(biāo)記的密度和新增49個家系對以上6個支持連鎖的區(qū)域進(jìn)行精細(xì)定位來進(jìn)一步鑒定出中國漢族尋常型最主要的易感基因位點。 [精細(xì)定位連鎖分析結(jié)果] ①染色體4q12-q21位點的連鎖分析 在4q12-q21區(qū)域內(nèi)，由最初全基因掃描5個有陽性結(jié)果的標(biāo)記

5、再新增12個標(biāo)記再進(jìn)行連鎖分析。所有這17個微衛(wèi)星標(biāo)記平均信息量達(dá)到93％。106個家系的多點非參數(shù)連鎖分析顯示在D4S392-D4S3042位點處獲得最大NPL值為4．62，其對應(yīng)的p值為0．000003；多點參數(shù)連鎖分析在隱性遺傳模式下，外顯率為99％時，在D4S3042-D4S2947位點處獲得最大HLOD值為4．0l和較高的連鎖家系比例or=31％。兩點連鎖分析顯示在D4S392位點處獲得最大NPL值為4．53，其對應(yīng)的p值為0

6、．000004；且在相同的位點在隱性遺傳模式下外顯率為99％時獲得最大HLOD值為5．97和較高的連鎖家系比例α=42％。此外，我們也對49個家系的微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行多點非參數(shù)連鎖分析顯示在D4S3042-D4S2947位點處獲得最大NPL值為4．29，其對應(yīng)的p值為0．0000l；多點參數(shù)連鎖分析在隱性遺傳模式下，外顯率為99％[t寸，在D4S392-D4S3042位點處獲得最大HLOD值為2．74和較高的連鎖家系比例α=35％。因此，全

7、基因組掃描及第二階段的精細(xì)定位的連鎖分析結(jié)果表明染色體4q12-q21是白癜風(fēng)一個新的主要易感位點。 ②染色體6p21．p22位點的連鎖分析 在6p21一p22區(qū)域內(nèi)，由最初全基因掃描6個有陽性結(jié)果的標(biāo)記再新增9個標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析。所有這15個標(biāo)記平均信息量達(dá)到95％。106個家系的多點非參數(shù)連鎖分析顯示在D6S422-D6S1660位點處獲得最大NPL值為3．16(p=0．00092)；多點參數(shù)連鎖分析在隱性遺傳模式下

8、，外顯率為99％時，在D6S1584-D6S422位點處獲得最大HLOD值為2．14和較高的連鎖家系比例α=32％。兩點非參數(shù)及參數(shù)連鎖分析值也同樣支持提示性連鎖易感位點。因此，精細(xì)定位的多點非參數(shù)連鎖值由最初全基因組掃描的2．67增加到3．16，連鎖信號雖有所增強(qiáng)，但仍略低于“提示性連鎖易感位點”的標(biāo)準(zhǔn)。 ③染色體6q23-q25位點的連鎖分析 在6q23-q25區(qū)域內(nèi)，由最初全基因掃描5個有陽性結(jié)果的標(biāo)記再新增6個標(biāo)

9、記進(jìn)行連鎖分析。所有這11個標(biāo)記平均信息量同樣達(dá)到90％以上。106個家系的多點非參數(shù)連鎖分析顯示在D6S311一D6S1687位點處獲得最大NPL值為2．98p=0．0014)；多點參數(shù)連鎖分析在隱性遺傳模式下，外顯率為99％時，在D6S441一D6S448位點處獲得最大HLOD值為137(ct=13％)，與全基因組掃描時相比該區(qū)域內(nèi)的連鎖信號仍未得到加強(qiáng)。 ④染色體lp36位點的連鎖分析 在1p36區(qū)域內(nèi)，由最初全基

10、因掃描5個有陽性結(jié)果的標(biāo)記再新增6個標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析。所有這11個標(biāo)記平均信息量同樣達(dá)到90％以上。106個家系的多點非參數(shù)連鎖分析顯示在D1S2734-D1S234位點處獲得最大NPL值為2．37(p=0．009)；多點參數(shù)連鎖分析在隱性遺傳模式下，外顯率為99％時，在D1S2734-D1S234位點處獲得最大HLOD值為1．17。該位點離Alkhateeb等報道的白種人的AIS1位點至少30cM遠(yuǎn)。因此中國家系的1號染色體上的提示性

11、連鎖結(jié)果并不支持以前白種人的AIS1位點連鎖證據(jù)。 ⑤染色體14q12-q13和22q12位點的連鎖分析 我們也在14q12一q13和22q12的2個區(qū)域內(nèi)對106個家系進(jìn)行連鎖分析，然而這些連鎖分析的結(jié)果在其他的49個家系中并未得到驗證。 總之，全基因組掃描及后來精細(xì)定位的連鎖分析結(jié)果確定了一個新的白癜風(fēng)連鎖位點在4q12一q21，該位點可能是中國白癜風(fēng)人群最主要的易感位點。在染色體1p36、6p21一p22、