DNA序列中相似性重復(fù)片段查找技術(shù)研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩61頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、生物信息學(xué)是20世紀(jì)80年代末,隨著人類基因組計劃的不斷發(fā)展、基因序列和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)的急速增加、以及信息理論和計算機技術(shù)的不斷發(fā)展而逐漸形成的。我們可以利用計算機技術(shù)對包括DNA、RNA和蛋白質(zhì)等生物序列進行分析,為生物學(xué)家提供更多有價值的信息。 在DNA序列分析中,重復(fù)片段查找是一個重要的基礎(chǔ)性問題。人類DNA序列50%以上是由重復(fù)片段組成的,這些重復(fù)片段隱含了大量的生物信息,其中包含豐富的古生物記錄,并提供許多關(guān)鍵的生物進化線

2、索。目前,重復(fù)片段作為一個重要的遺傳標(biāo)記,已廣泛運用于精密遺傳連鎖作圖、腫瘤生化研究、法醫(yī)學(xué)個體識別、親子鑒定和群體遺傳學(xué)分析等領(lǐng)域。 相似性重復(fù)片段的查找是近年來一個熱點的研究問題。相比于精確重復(fù)片段查找,相似性重復(fù)片段的查找是一個較為新穎且難度較大的問題。針對這個問題,本文對DNA序列中的相似性重復(fù)片段查找進行了深入研究,提出了一種在DNA序列中查詢相似性重復(fù)片段的高效方法。本文的主要工作總結(jié)如下: (1) 本文首先

3、提出了一種新的衡量相似性重復(fù)片段相似性的標(biāo)準(zhǔn),這種新的標(biāo)準(zhǔn)既表達(dá)了距離和待比較片段間的長度關(guān)系,同時又避免了模式之間長度必須相同的限制; (2) 針對以往方法只能查找模式長度基本相同的相似性重復(fù)片段的缺陷,利用一種新的輕量級索引結(jié)構(gòu)——后繼數(shù)組,提出了一種新的序列劃分方法,這種方法可以使查找到的相似性重復(fù)片段的各個模式的長度不受限制; (3) 由于相似性重復(fù)片段查找的計算的高復(fù)雜性,本文提出了基于頻率距離的過濾方法,

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論