小菜蛾免疫Bt動力學的DGE分析及其PGRP-LB基因的克隆.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、肽聚糖識別蛋白(PGRPs)是昆蟲免疫系統(tǒng)中一類重要的模式識別受體,在識別入侵病原物及激活免疫信號通路(Toll和 Imd)中發(fā)揮重要作用。為探討PGRPs基因在重要農業(yè)害蟲小菜蛾(Plutella xylostella)免疫識別高致病性蘇云金芽孢桿菌HD73(Bt)等病原微生物中的作用,本研究在測定 Bt侵染小菜蛾不同時間后的數字基因表達譜(DGE)基礎上,利用生物信息學分析了小菜蛾免疫防御Bt侵染的相關基因,探討了小菜蛾免疫防御Bt

2、侵染的動力學分子機制;運用RT-PCR結合RACE技術克隆了 PGRP-LB1和 PGRP-LB2基因的cDNA全長序列,在此基礎上運用qRT-PCR(Quantitative Real-time PCR)技術研究了Bt侵染后PGRP-LB1和PGRP-LB2基因的時空表達模式;運用飼喂法 RNAi技術對 PGRP-LB1和 PGRP-LB2免疫識別Bt的侵染進行了初步的探索。主要研究結果如下:
  為探討小菜蛾免疫防御Bt侵染的

3、動態(tài)學機制。本研究基于RNA-Seq技術測定了Bt侵染小菜蛾不同時間(6h、12 h、18h、24h和36 h)后的DGE。以小菜蛾基因組作為背景,比較了分析了Bt侵染小菜蛾6h、12 h、18h、24h和36 h后的差異表達基因。DGE測定結果顯示:Bt處理小菜蛾6h時,獲得2573個差異表達基因,其中747個上調,1826個下調;免疫相關基因249個,其中5個上調,97個下調。Bt處理12h時,獲得1582個差異表達基因,其中119

4、0個上調,392個下調;免疫相關基因249個,其中8個上調,37個下調。Bt處理18h時,獲得1036個差異表達基因,其中568個上調,468個下調;免疫相關基因249個,其中7個上調,51個下調。Bt處理24h時,獲得3404個差異表達基因,其中2746個上調,658個下調;免疫相關基因249個,其中30個上調,49個下調。Bt處理36h時,獲得4396個差異表達基因,其中3877個上調,519個下調;免疫相關基因249個,其中53個

5、上調,53個下調。
  在這些差異表達基因中,PGRP家族、Spatzle和Toll家族基因表達上調,表達差異顯著;Cactus、Imd和relish下調表達差異顯著;抗菌肽基因中,只有Lysozyme(Lys)家族表達上調,其次過氧化為酶和超氧化物歧化酶表達上調。以上結果表明PGRP家族在識別Bt侵染及啟動Toll信號通路,并結合Lys家族協同免疫防御Bt的侵染。Bt侵染誘導了Toll基因的表達上調以及Imd基因的表達下調,表明

6、小菜蛾免疫防御Bt侵染不僅僅是通過Toll的上調,還有可能是通過Imd、relish通路的下調來增強免疫防御能力。其次9個PGRPs中,根據不同處理的RPKM值找到具有明顯差異的兩個PGRP基因,即PGRP-LB1和PGRP-LB2,與PBS處理6h相比較,PGRP-LB1在6h和42h各有一個小高峰為69倍和35倍,PGRP-LB2在6h和42h各有一個小高峰為309倍和513倍,表明PGRP-LB1和PGRP-LB2在小菜蛾免疫識別

7、Bt過程中具有重要作用。
  為進一步探討PGRP-LB1和PGRP-LB2的功能。根據PGRP-LB1和PGRP-LB2 Unigene序列設計引物,通過 RT-PCR結合 RACE方法克隆了小菜蛾 PGRP-LB1和PGRP-LB2這兩個基因的cDNA全長序列,其中PxPGRP-LB1基因全長為937bp,完整開放閱讀框為594bp,可編碼197個氨基酸殘基,預測成熟肽分子量為21.197kDa,等電點為5.48。PxPGRP

8、-LB2基因全長為772bp,完整開放閱讀框為612bp,可編碼204個氨基酸殘基,預測成熟肽分子量為22.114 kDa,等電點為7.40,前18個氨基酸具有分泌蛋白信號肽的特征,推測為一種分泌蛋白。序列比對及進化關系分析表明,PxPGRP-LB1和PxPGRP-LB2隸屬于PGRP-LB家族。
  為探討PxPGRP-LB1和PxPGRP-LB2基因的表達模式和對病原微生物誘導后表達的敏感度。qRT-PCR檢測結果表明PxPG

9、RP-LB1和PxPGRP-LB2在小菜蛾mRNA水平上具有不同程度的上調表達,且PGRP-LB1在誘導6h時表達量達到最高峰,之后一直減少,在18h有另一個小高峰;對于PGRP-LB2在18h表達量達到最高峰。組織特異性檢測結果表明,體壁中,均在48h表達量達到最高峰;在血細胞中也都在48h有一誘導高峰;在中腸中,對于PGRP-LB1基因在18h達到誘導高峰,而PGRP-LB2在48h誘導量才達到最大。在脂肪體中,18h達到表達量最大

10、,而 PGRP-LB2在6h表達量達到最大;在馬氏管中,兩個基因均在48h表達量達到最大,表明兩個基因表達存在組織差異性。
  為探討PxPGRP-LB1和PxPGRP-LB2在小菜蛾免疫識別Bt過程中的作用。本研究成功構建了L4440-GFP、L4440-PGRP-LB1和L4440-PGRP-LB2表達質粒,并將該質粒轉入表達宿主菌HT115中,將1×107CFU/ml的表達菌株飼喂小菜蛾二齡幼蟲,24h之后,飼喂1×105C

11、FU/ml的Bt菌,結果表明小菜蛾死亡率升高,表明通過飼喂可以沉默PGRP-LB基因的表達。
  綜上所述,運用DGE明確了小菜蛾免疫Bt的相關基因及其表達的動力學,為研究小菜蛾與Bt侵染的互作機制提供了靶標免疫基因。成功克隆了小菜蛾免疫Bt的關鍵基因PxPGRP-LB1和PxPGRP-LB2,不僅補充了PGRP家族成員;在此基礎上成功構建了飼喂小菜蛾的細菌干擾系統(tǒng),為研究小菜蛾相關免疫基因的功能提供了新的干擾技術,也為基于小菜蛾

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