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文檔簡(jiǎn)介
1、本文選取來(lái)自于核基因組和葉綠體的三個(gè)DNA序列片段,對(duì)東北地區(qū)丁香屬進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育的重建,主要探討了東北地區(qū)丁香屬下系統(tǒng)的劃分和屬下分類(lèi)群間的親緣關(guān)系。對(duì)東北地區(qū)丁香屬植物進(jìn)行大量的分子系統(tǒng)學(xué)研究的同時(shí),還對(duì)其形態(tài)性狀進(jìn)行了分支分析,探討了丁香屬的起源和演化問(wèn)題。主要內(nèi)容包括: 1、基于形態(tài)性狀的分支分析通過(guò)對(duì)東北地區(qū)應(yīng)用的丁香屬植物的形態(tài)學(xué)性狀的觀察,采用分支系統(tǒng)學(xué)的方法,對(duì)其進(jìn)行分支分析,利用PHYLIP和MEGA軟件,分別應(yīng)
2、用最大簡(jiǎn)約法和UPGMA法對(duì)其進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,結(jié)果表明:東北地區(qū)丁香屬植物分為4個(gè)分支,分別屬于Rehder(1928)分類(lèi)方法組1和組2中的不同的系,從一個(gè)側(cè)面說(shuō)明基于經(jīng)典分類(lèi)劃分的系是比較自然的,而我們研究后認(rèn)為去除組的劃分,將丁香屬分為五系,即頂生花序系(Ser.Villosae)、歐丁香系(Ser.Syringa)、巧玲花系(Ser.Pubescentes)、羽葉丁香系(Ser.Pinnatifoliae)和短花冠系(Ser.
3、Ligusttina)。 2、葉綠體TrnL-trnF間區(qū)序列及系統(tǒng)發(fā)育擴(kuò)增并分析了東北地區(qū)丁香屬11種植物及外類(lèi)群的tmL-trnF基因間隔區(qū)序列,其長(zhǎng)度變異范圍為362-374bp,排序后的長(zhǎng)度為382bp,其中35個(gè)變異位點(diǎn),所占比例為9.16%,序列的G+C平均含量為37.2%,說(shuō)明trnL-tmF序列的A+T含量較高。對(duì)東北地區(qū)丁香屬植物基于cpDNA的TmL-tmF間區(qū)序列應(yīng)用MP法、ML法、UPGMA法和NJ法構(gòu)建
4、系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果表明:在東北地區(qū)丁香屬植物內(nèi)穩(wěn)定的分成四個(gè)類(lèi)群,洋丁香、朝鮮丁香、什錦丁香和紫丁香構(gòu)成一個(gè)類(lèi)群,即歐丁香系(Ser.Syrinag),關(guān)東丁香、小葉丁香和毛丁香構(gòu)成一個(gè)類(lèi)群,即巧玲花系(Set.Pubescentes),紅丁香和遼東丁香構(gòu)成一個(gè)類(lèi)群,即頂生花序系(Set.Villosae),北京丁香和暴馬丁香構(gòu)成一個(gè)類(lèi)群,即短花冠管組(Sect.Ligustrina)。不同方法分析的各類(lèi)群之間的關(guān)系不同,構(gòu)建的發(fā)育樹(shù)存在
5、一定的差異。 3、nrDNA ITS序列的分析及系統(tǒng)發(fā)育東北地區(qū)丁香屬11種植物及外類(lèi)群的ITS序列4種核苷酸量平均為A=30.5%,C=21.5%,G=32.0%,T=16.0%。將所獲得的ITS序列排序后,比較形成了一個(gè)含623個(gè)位點(diǎn)的矩陣,其中544個(gè)不變位點(diǎn),79個(gè)變異位點(diǎn),所占比例為12.7%,ITS序列的G+C含量較高,都在50%以上,平均含量為54.8%。東北地區(qū)丁香屬內(nèi)G+C含量相差不大,最低的是洋丁香,為53.
6、86%,最高的為北京丁香為55.86%,而東北連翹的G+C含量為54.9%。對(duì)東北地區(qū)丁香屬植物基于ITS區(qū)序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析后發(fā)現(xiàn),在東北地區(qū)丁香屬植物內(nèi)穩(wěn)定的分成四個(gè)類(lèi)群,與TmL-trnF間區(qū)研究結(jié)果相同,但基于不同的系統(tǒng)分析方法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)在屬下各分類(lèi)群的之間的親緣關(guān)系的確定上有一定的差異。 4、nrDNh ETS序列的分析及系統(tǒng)發(fā)育東北地區(qū)丁香屬11種植物ETS序列4種核苷酸量平均為A=19.8%,C=24.
7、5%,G=24.6%,T=31.2%。將所獲得的ETS序列排序后,比較形成了一個(gè)含380個(gè)位點(diǎn)的矩陣,其中323個(gè)不變位點(diǎn),57個(gè)變異位點(diǎn),所占比例為15%,東北地區(qū)丁香屬植物ETS序列的G+C含量在48%-50%以下,平均含量為48.99%。東北地區(qū)丁香屬內(nèi)G+C含量相差不大,最低的是毛丁香,為48.1%,最高的為朝鮮丁香為50.0%,而遼東水臘的G+C含量為48.94%。對(duì)東北地區(qū)丁香屬植物基于ETS區(qū)序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析后發(fā)現(xiàn)
8、,在東北地區(qū)丁香屬植物內(nèi)穩(wěn)定的分成四個(gè)類(lèi)群,與TmL-trnF間區(qū)、ITS序列的研究結(jié)果相同,但應(yīng)用系統(tǒng)分析方法所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)在屬下各分類(lèi)群的之間的親緣關(guān)系的確定上與TrnL-tmF間區(qū)、ITS序列的研究結(jié)果有一定的差異。 綜合文獻(xiàn)資料和本研究結(jié)果,我們認(rèn)為: 1、cpDNA TrnL-trnF間區(qū)序列、nrDNA ITS和ETS序列在研究丁香屬下分類(lèi)和丁香屬植物的系統(tǒng)進(jìn)化方面可以提供一定的變異位點(diǎn),在種間的系統(tǒng)發(fā)育
9、重建研究中可以提供較豐富的信息,具有一定的研究?jī)r(jià)值。 2、丁香屬植物的經(jīng)典分類(lèi)劃分的系是比較自然的,而我們研究后認(rèn)為去除組的劃分,將丁香屬分為五系,即頂生花序系(Ser.Villosae)、歐丁香系(Ser. Syringa)、巧玲花系(Ser.Pubescentes)、羽葉丁香系(Ser.Pinnatifoliae)和短花冠系(Ser.Ligustrina)。 3、基于不同的序列和不同的系統(tǒng)分析方法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)在屬
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