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文檔簡(jiǎn)介
1、土壤作為生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分之一,是珍貴的自然資源。而土壤微生物作為土壤中的活性組分,在維持土壤生態(tài)平衡如養(yǎng)分運(yùn)轉(zhuǎn)、有機(jī)質(zhì)分解和環(huán)境污染物凈化中發(fā)揮著重要作用。土壤微生物群落結(jié)構(gòu)組成及活性變化又是衡量土壤質(zhì)量、維持土壤肥力和作物生產(chǎn)力的一個(gè)重要指標(biāo)。
本課題首先運(yùn)用PCR為基礎(chǔ)的rRNA文庫(kù)的方法,以高次團(tuán)粒土壤微生物宏基因組為模板,成功克隆測(cè)序了其原核16S rRNA基因及真核ITS序列,初步解析了冠中土壤微生物群落的組成
2、結(jié)構(gòu)。其次是針對(duì)所獲得的16S序列使用基于單堿基差異識(shí)別的特異引物設(shè)計(jì)技術(shù),即在設(shè)計(jì)過(guò)程中人為引入錯(cuò)配堿基,增加引物特異性,由此設(shè)計(jì)出5個(gè)門(mén)的特異性引物。最后,經(jīng)過(guò)篩選和PCR條件優(yōu)化,將設(shè)計(jì)的引物用于不同比例混合質(zhì)粒模板和新的土壤微生物宏基因組的實(shí)時(shí)熒光定量PCR,從而達(dá)到對(duì)幾個(gè)門(mén)的微生物進(jìn)行快速定量識(shí)別的目的。
基于單堿基差異識(shí)別的特異性引物技術(shù)設(shè)計(jì)門(mén)特異性引物,打破了傳統(tǒng)方法設(shè)計(jì)引物的局限,更有助于提高引物對(duì)目標(biāo)序列識(shí)別
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