用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選水稻抗白葉枯病相關(guān)蛋白.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、水稻(Oryza sativa L.)不僅是我國的第一大農(nóng)作物,也是單子葉的模式植物,在生產(chǎn)實踐和科學(xué)研究中都占有極其重要的地位。水稻全基因組測序的完成宣告了水稻功能基因組學(xué)時代的到來。蛋白質(zhì)組學(xué)是在蛋白質(zhì)整體水平上研究基因的功能,是近幾年來生命科學(xué)研究領(lǐng)域的一大熱點,是生命科學(xué)進入功能基因組時代的標志之一。 以Bio-Rad高通量雙向電泳系統(tǒng)為技術(shù)平臺,通過改進和優(yōu)化水稻葉蛋白的提取方法及電泳條件,建立了適合水稻葉總蛋白的高通

2、量、高分辨率和高重復(fù)性的雙向電泳技術(shù)體系。在水稻葉蛋白雙向電泳圖譜上能檢測到至少1000個蛋白點。兩次重復(fù)實驗的雙向電泳圖譜的相關(guān)系數(shù)為0.964。 由水稻黃單胞菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)引起的白葉枯病是世界水稻生產(chǎn)中最嚴重的細菌性病害,是研究植物與病原細菌互作的模型系統(tǒng)。本論文利用建立的雙向電泳技術(shù)體系分析了水稻體細胞雜交抗病新種質(zhì)葉片在接種Xoo非親和小種ZHE173后24 h、4

3、8 h、72 h的蛋白質(zhì)組變化情況,得出如下結(jié)果: 1.接種Xoo后48 h可能是在蛋白質(zhì)水平上水稻與白葉枯病菌非親和互作反應(yīng)的關(guān)鍵時間。發(fā)現(xiàn)共有77個蛋白點在接種Xoo后表達發(fā)生顯著變化。其中17個蛋白點在處理的3個時間點均發(fā)生了差異表達,8個蛋白點在24 h和48 h差異表達,20個蛋白點在48 h和72 h發(fā)生差異表達,31個蛋白點只在48 h差異表達以及1個蛋白點只在24 h差異表達。77個差異表達蛋白點中,有76個點在

4、48 h呈現(xiàn)表達差異。 2.分離出3個之前未曾報道過的水稻抗病相關(guān)蛋白。植物硫肽激素受體前體(PSKR)屬于絲氨酸/蘇氨酸激酶家族,具有富含亮氨酸重復(fù)區(qū)(IRR)和絲氨酸/蘇氨酸激酶結(jié)構(gòu)域(STK),定位于膜上,通過結(jié)合植物硫肽激素引發(fā)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。磷脂酰肌醇-3激酶相關(guān)蛋白激酶(PIKK)是一類調(diào)控細胞生長、基因表達和基因組監(jiān)測及修復(fù)的信號蛋白,PIKKs蛋白家族在真核細胞應(yīng)答各種脅迫中扮演著重要的角色。生長素調(diào)節(jié)蛋白是一類由

5、生長素調(diào)節(jié)基因家族編碼的蛋白。序列分析表明,該蛋白含有2個重復(fù)的谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(GST)的N末端結(jié)構(gòu)域。 3.葉綠體可能是受Xoo侵染影響最大的一個細胞器。利用TargetP程序?qū)?4個被鑒定的差異蛋白進行亞細胞定位預(yù)測,23個蛋白點定位于具體的細胞器上,而其中有15個蛋白定位于葉綠體上。Xoo侵染后,1,5-二磷酸核酮糖羧化加氧酶大亞基(RcLb)的大片段表達下調(diào),而小片段表達上調(diào),推測RcLb及其片段發(fā)生了降解,并使用免

6、疫印跡技術(shù)加以驗證。 本研究首次利用蛋白質(zhì)組學(xué)方法分析以疣粒野生稻為抗源的體細胞雜種在Xoo侵染后的蛋白質(zhì)組變化情況,揭示了抗病新種質(zhì)對Xoo的抗性是通過一個復(fù)雜的胞內(nèi)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)來實現(xiàn)的。在77個差異表達蛋白中,有64個得到鑒定,其中51個已知功能的蛋白可以被分為5類:光合作用相關(guān)蛋白、抗氧化防御蛋白、蛋白更新、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和代謝。利用TargetP程序?qū)?4個被鑒定的差異蛋白進行亞細胞定位預(yù)測,其中15個蛋白定位在葉綠體,8個蛋白定

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