BMPER和FABP2基因啟動子區(qū)變異與豬肌內(nèi)脂肪含量相關性研究.pdf

1、肌內(nèi)脂肪含量(IMF)是影響豬肉品質(zhì)最關鍵的因之一。一般認為，IMF越低，肌肉的多汁性、嫩度、風味及總體可接受度越低。IMF的提高能夠很好的改善豬肉的感觀品質(zhì)和食用品質(zhì)，因此，提高IMF已成為當今畜牧業(yè)、尤其是遺傳育種領域的研究熱點。
　　本研究在前期SNP芯片分析的基礎上，選擇BMPER和FABP2基因作為候選基因，研究其啟動子區(qū)變異與豬肌內(nèi)脂肪含量的相關性，并對突變位點的功能進行驗證和分析。
　　實驗一驗證了BMPER基

2、因啟動子區(qū)兩個SNP位點與IMF的相關性。首先通過構建DNA池及BMPER啟動子區(qū)序列的PCR擴增結合測序分析發(fā)現(xiàn)c.-1344 A＞C與c.-1423 A＞G兩個SNP位點;采用PCR-SSCP技術對這兩個位點進行基因分型，結果顯示這兩個位點為連鎖的單倍型，且在三元雜交外種豬群體中只有AA/AA和GC/GC兩種基因型。其次通過對不同基因型個體的BMPER表達水平的分析、與IMF含量的關聯(lián)分析以及兩種單倍型的熒光活性分析結果顯示，AA/

3、AA基因型表達水平和IMF含量都顯著高于GC/GC基因型(p＜0.05)，且AA單倍型啟動子活性也顯著高于GC單倍型(p＜0.01)。
　　實驗二采用同樣的方法驗證了FABP2基因啟動子區(qū)的SNP位點對IMF以及FABP2表達水平的影響。首先通過構建DNA池作為擴增FABP2調(diào)控區(qū)序列的模板并結合測序分析發(fā)現(xiàn)在FABP2啟動子區(qū)存在c.-1488C＞T, c.-1485G＞A，c.-1471T＞C，c.-1407T＞C，c.-14