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文檔簡介
1、急性病毒性壞死病毒(acute viral necrosis virus, AVNV)是20世紀(jì)末導(dǎo)致我國北方沿海櫛孔扇貝大規(guī)模死亡的的重要致病病原。隨著AVNV的全基因組序列的測定完成,確定該病毒全基因組序列一共包含123個可能的開放型閱讀框(open reading frames, ORF),其中的44個開放型閱讀框具有一定的結(jié)構(gòu)和功能。本論文通過基因克隆、原核表達(dá)、真核表達(dá)以及體外功能分析等技術(shù)研究其中兩種功能基因的功能,這對了解
2、AVNV的侵染機(jī)制和致病機(jī)理,從而為AVNV的防控提供有效理論依據(jù)。
研究內(nèi)容和結(jié)果如下:
第一部分:通過基因克隆技術(shù)得到了AVNV ORF86編碼的桿狀病毒凋亡抑制蛋白基因(IAP-86),將IAP-86基因與pET32a(+)質(zhì)粒連接構(gòu)建得到重組質(zhì)粒pET32a-IAP86,之后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到 E.coil BL21(DE3)中,使用終濃度0.1%的異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)進(jìn)行蛋白誘導(dǎo)表達(dá),SD
3、S-PAGE檢測顯示表達(dá)蛋白分子量約為40ku,經(jīng)Western-blotting和質(zhì)譜分析證明該蛋白即為IAP-86融合蛋白,Co2+柱純化后得到了純化的的IAP-86融合蛋白。
第二部分:對原核表達(dá)得到的IAP-86蛋白進(jìn)行功能性分析,首先將重組的IAP-86蛋白用FITC標(biāo)記,熒光顯微鏡下觀察,發(fā)現(xiàn)重組的IAP-86蛋白最終能夠與櫛孔扇貝血淋巴細(xì)胞的細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)結(jié)合,提示重組的IAP-86蛋白能夠進(jìn)入到細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮作用。
4、使用細(xì)胞凋亡檢測試劑盒針對 IAP-86的抗凋亡作用進(jìn)行分析,實驗結(jié)果證實重組的IAP-86蛋白能夠在一定程度上抑制櫛孔扇貝血淋巴細(xì)胞凋亡,凋亡抑制率在7%左右。
第三部分:為深入探討魁蚶中檢測到的急性病毒性壞死病毒(acute viral necrosis virus, AVNV)魁蚶株的致病機(jī)理以及進(jìn)一步研究IAP-86蛋白的功能,本實驗從感染AVNV的瀕死魁蚶外套膜中提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA。根據(jù)NCBI公布的A
5、VNV全基因組序列中ORF86序列設(shè)計兩對反向套式引物,通過cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)獲得ORF865’端和3’端的非編碼區(qū),拼接獲得全長cDNA序列。Blast序列比對顯示,該基因與牡蠣皰疹病毒的相似性為100%,與櫛孔扇貝AVNV的相似性為99%,并存在重疊基因。生物信息學(xué)分析預(yù)測該蛋白不含有信號肽,不存在跨膜區(qū),最大疏水指數(shù)為1.800,最小疏水指數(shù)為-3.456。存在8個潛在的磷酸化位點(包括5個絲氨酸、1個蘇氨酸和2
6、個酪氨酸),存在1個潛在的O-糖基化位點,不存在潛在的N-糖基化位點;其抗原表位主要集中在8-11、14-16、28-39、75-76、88-95、97-100和147-158位氨基酸。
第四部分:在使用原核表達(dá)技術(shù)對AVNV解旋酶進(jìn)行表達(dá)未獲得成功的前提下,嘗試使用酵母表達(dá)系統(tǒng)對AVNV解旋酶進(jìn)行真核表達(dá),本部分通過基因克隆技術(shù)獲得了表達(dá) AVNV解旋酶的開放閱讀框-ORF66,并將該基因連接到 pPIC9K表達(dá)載體上,構(gòu)建
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