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文檔簡介
1、肝臟的再生機(jī)制是肝臟研究中一個關(guān)鍵而復(fù)雜的問題。對于這一涉及復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的多階段生理過程,全面系統(tǒng)的展示其分子基礎(chǔ)至關(guān)重要。近幾年,比較蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展為研究肝再生分子機(jī)制提供了技術(shù)平臺,迅速推進(jìn)了肝再生相關(guān)效應(yīng)因子、信號通路的數(shù)據(jù)積累。而針對亞細(xì)胞蛋白質(zhì)組的研究策略能提供蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位信息,從而有助于研究者闡釋其作用機(jī)理,更進(jìn)一步理解其在肝再生整體調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中所處的位置。
脂肪滴(Lipid Droplets)作為脂質(zhì)
2、代謝調(diào)控的中心細(xì)胞器,廣泛參與多種生理過程。研究顯示脂肪滴與其他細(xì)胞器存在普遍的相互作用和分子交流,并能通過調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)的脂質(zhì)平衡,輔助細(xì)胞應(yīng)對特定時期和狀況下的細(xì)胞環(huán)境。近年有研究報道肝臟細(xì)胞內(nèi)的脂肪滴在肝再生早、中期大量積累,與肝再生進(jìn)程密切關(guān)聯(lián),但其中機(jī)制尚未明確,有待探討。
本研究以2/3肝切除的大鼠為肝再生模型,首次應(yīng)用八標(biāo)iTRAQ(8-plexisobaric Tags for Relative and Absol
3、ute Quantitation)技術(shù)結(jié)合2D LC-MS/MS以正常大鼠肝組織和假手術(shù)大鼠肝組織為對照,全面分析了再生早期(6h,12h)、中期(24h,48h)和晚期(72h,120h)肝臟細(xì)胞內(nèi)脂肪滴蛋白質(zhì)的表達(dá)差異,以期為深入探討脂肪滴調(diào)控肝再生的機(jī)制做好鋪墊。目前,課題主要獲得如下結(jié)果。
第一、大鼠肝再生各時間點的脂肪滴蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定結(jié)果通過IPI數(shù)據(jù)庫檢索共得到248種蛋白質(zhì),對應(yīng)到200個基因,與以往的脂肪滴蛋
4、白質(zhì)組研究結(jié)果比較,其中158個為本研究首次鑒定。利用GO(Gene Ontology)對這些基因的分子功能、生物過程和細(xì)胞組分的注釋進(jìn)行分類分析,結(jié)果提示脂肪滴蛋白質(zhì)可能與細(xì)胞增殖狀態(tài)相關(guān),參與調(diào)節(jié)肝再生進(jìn)程中脂肪合成、積累和分解代謝,以保持細(xì)胞能量供給穩(wěn)定,提供生物膜合成底物,并調(diào)節(jié)胞內(nèi)的氧化水平,防止胞漿中脂質(zhì)過量形成的細(xì)胞毒性等。
第二、利用Protein Pilot軟件給出的蛋白質(zhì)定量信息,對各時間點的脂肪滴蛋白質(zhì)的
5、整體表達(dá)模式進(jìn)行分層聚類分析,結(jié)果顯示術(shù)后脂肪滴蛋白質(zhì)組的表達(dá)變化與肝再生進(jìn)程緊密相關(guān):肝再生早期6h和12h的表達(dá)模式相似,而24h的與二者相近;隨后48h和72h的表達(dá)譜相似,而120h的與二者相近;在這6個時間點中,肝再生晚期120h的蛋白表達(dá)變化最接近于假手術(shù)組。這些結(jié)果與我們的理論預(yù)期相符,也顯示了八標(biāo)iTRAQ技術(shù)是平行分析多組蛋白質(zhì)樣品的有效工具。
第三、本研究共發(fā)現(xiàn)29種蛋白質(zhì)在大鼠肝再生過程中呈現(xiàn)差異表達(dá),其
6、中14種主體上呈上調(diào)表達(dá),15種呈下調(diào)表達(dá)。如脂肪滴表面17-β HSD11/13、ACSL的水平在術(shù)后24h顯著上調(diào),而脂肪結(jié)合蛋白L-FABP在肝再生24h-72h期間出現(xiàn)顯著下調(diào),這些蛋白質(zhì)可能通過調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)的運輸、合成和代謝,參與肝再生中損傷應(yīng)激和細(xì)胞增殖等生物進(jìn)程。
總結(jié):本研究首次建立了脂肪滴蛋白質(zhì)在肝再生中的動態(tài)變化圖譜,發(fā)現(xiàn)了潛在的差異分子,并系統(tǒng)探討了脂肪滴及其表面蛋白參與調(diào)節(jié)肝再生進(jìn)程的可能途徑和方式:
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