基于SCoT和SSR標記的藥用菊花種質資源遺傳多樣性研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩83頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、菊花(Chrysanthemum morifolium Ramat)是菊科(Asteraceae)菊屬的多年生草本植物,具有很高的觀賞價值和藥用價值,在觀賞園藝及傳統(tǒng)醫(yī)藥領域有著廣泛的應用。藥用菊花品種繁多,遺傳背景比較復雜,不過目前藥用菊花的種質創(chuàng)新缺少突破性的進展。因此,為了藥用菊花的充分利用和種質選育,開展藥用菊花種質遺傳多樣性評價及保護研究是十分急迫和必要的。
  本研究首先基于數(shù)據(jù)庫中菊花同屬近緣種的EST序列開發(fā)了一批

2、穩(wěn)定性、通用性好和多態(tài)性高的藥用菊花SSR標記。然后利用SCoT和SSR兩種分子標記對32份藥用菊花進行遺傳多樣性檢測與評價。旨在為藥用菊花的品種鑒定、遺傳多樣性研究及遺傳資源道地性保護提供可靠的參考數(shù)據(jù),為實現(xiàn)最大限度的保存藥用菊花遺傳多樣性的策略提供科學依據(jù)。主要研究方法與結果如下:
  1、試驗建立并優(yōu)化了SCoT和SSR反應體系:
 ?。?)藥用菊花SCoT-PCR最佳反應體系(20μL):含模板DNA10 ng,1

3、0×PCR buffer2.0μL,引物0.8μmol/L,dNTPs0.2 mmol/L,Mg2+2.0 mmol/L,Taq酶1.5 U。SCoT-PCR擴增程序:94℃預變性4 min;35個循環(huán)(94℃變性1 min,引物Tm值復性1 min,72℃延伸2 min);72℃延伸10 min,4℃保存。
  (2)藥用菊花SSR-PCR最佳反應體系(20μL):含模板DNA60 ng,10×PCR buffer2.0μL,正

4、、反向引物各0.25μmol/L,dNTPs0.3 mmol/L,Mg2+3.0 mmol/L,Taq酶1.5 U。SSR-PCR擴增程序:94℃預變性5 min;35個循環(huán)(94℃變性40 s,引物Tm值復性40 s,72℃延伸1 min);72℃延伸10 min,4℃保存。
  2、基于菊屬植物的序列表達標簽(EST)序列成功開發(fā)藥用菊花EST-SSR引物18對,并利用該引物對采自浙江桐鄉(xiāng)的杭菊“小洋菊”群體的32個單株進行微

5、衛(wèi)星位點與多態(tài)性分析,結果表明,每個位點等位基因數(shù)在3~11個之間,每個位點期望雜合度He為0.5448~0.7639。
  3、基于SSR和SCoT標記的藥用菊花遺傳多樣性分析:
 ?。?)SCoT標記分析:篩選出的32條引物共擴增出872條帶,不同引物的多態(tài)性百分比在73.08%~100%之間,平均多態(tài)性比率為90.02%。多態(tài)性信息含量變化范圍為0.950~0.993(0.975,PIC>0.5);各材料的遺傳相似系數(shù)

6、在0.565~0.882之間。
 ?。?)SSR標記分析:成功應用了55對理想引物,共擴增出1319條帶,大多數(shù)條帶大小集中在100~500bp,其中多態(tài)性條帶有1306條(占98.90%)。不同引物的多態(tài)性百分比在92.0%~100%之間。多態(tài)性信息含量變化范圍為0.938~0.993(0.973,PIC>0.5);各材料的遺傳相似系數(shù)范圍為0.533~0.809。
  (3)基于兩種標記數(shù)據(jù)合并后的UPGMA聚類結果顯示

7、,藥用菊花種質間的遺傳相似系數(shù)為0.553~0.831,另外通過UPGMA聚類和主坐標分析發(fā)現(xiàn),SCoT和SSR及整合標記(SCoT+SSR)均將32份藥用菊花種質聚為兩大類,I類包括22份種質,II類包括10份。
  4、SCoT、SSR及SSR+SCoT標記之間的相關性分析:應用Mantel測驗對SCoT、SSR及綜合標記進行相關性分析,結果發(fā)現(xiàn),SCoT和SSR標記相關性顯著(r=0.48,P=1.00),但綜合標記(SSR

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論