關(guān)聯(lián)規(guī)則在生物信息學(xué)應(yīng)用研究.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、隨著生物信息學(xué)的發(fā)展,數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)為其提供了越來越重要的技術(shù)支持,而關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘技術(shù)是數(shù)據(jù)挖掘領(lǐng)域中的重要組成部分。但在應(yīng)用過程中由于生物數(shù)據(jù)的特點(diǎn),傳統(tǒng)算法需要進(jìn)一步改進(jìn)或重新提出新的算法以滿足生物信息學(xué)的研究要求。 本文首先提出了一種在分布式環(huán)境下挖掘項(xiàng)約束多層關(guān)聯(lián)規(guī)則的有效算法:基于Apriori算法的MLACD算法。該算法適用于對(duì)通信性能要求不高的分布式數(shù)據(jù)庫,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)在不同層 次上進(jìn)行關(guān)聯(lián)規(guī)則挖

2、掘。 針對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)每個(gè)樣本項(xiàng)非常多的特點(diǎn),本文提出了一個(gè)新穎的挖掘頻繁閉合模式的算法REMFOR,該算法在閉合模式概念和行枚舉思想的基礎(chǔ)上,采用垂直數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和fp-tree技術(shù),對(duì)行集建立行fp-tree來挖掘頻繁閉合模式。通過實(shí)例和實(shí)驗(yàn)證明該算法在處理基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)集或行數(shù)遠(yuǎn)小于樣本項(xiàng)個(gè)數(shù)的數(shù)據(jù)集時(shí)具有很高的效率。 本文采用興趣規(guī)則組概念得到關(guān)聯(lián)規(guī)則并以關(guān)聯(lián)規(guī)則建立分類器,并對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)樣本進(jìn)

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