基因表達譜數(shù)據(jù)的挖掘研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩47頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、基因芯片技術的出現(xiàn)使得研究者可以同時分析上萬個基因在各種生理狀態(tài)或不同的發(fā)育階段的表達情況以揭示它們的功能和相互之間的作用關系。目前,該技術已經被廣泛地應用于醫(yī)學疾病診斷和治療,藥物篩選和鑒定、農作物育種、環(huán)境監(jiān)測等領域。面對海量基因表達譜數(shù)據(jù),如何利用這些數(shù)據(jù)研究基因間的調控關系成為當前生物信息學的一個重要領域,使用數(shù)學模型對基因表達數(shù)據(jù)進行挖掘已成為研究熱點。本文針對基因表達譜數(shù)據(jù)提出了幾種數(shù)據(jù)挖掘方法,并對珊瑚基因的時間序列表達譜

2、數(shù)據(jù)進行了深入分析。
  在第一章,論文簡單地介紹了基因芯片技術,分析了目前基因表達譜數(shù)據(jù)挖掘的研究現(xiàn)狀,概括了本文的主要研究工作。
  在建立基因邏輯網絡時,需要知道基因是處于“表達”還是“抑制”狀態(tài),而數(shù)據(jù)庫中給出的表達譜數(shù)據(jù)只代表基因的表達水平并未給出確切的表達狀態(tài)。因此,在第二章中,我們給出了一種基于遺傳算法和LVQ網的基因表達數(shù)據(jù)閾值分析方法。對于小的數(shù)據(jù)集,直接用遺傳算法優(yōu)化的Otsu算法找出閾值并給出二值分類結

3、果。對于大的數(shù)據(jù)集,先選出它的一個子集,并用遺傳算法優(yōu)化的Otsu算法對其進行處理;然后,將處理結果后作為遺傳算法優(yōu)化 LVQ網絡的訓練集對網絡進行訓練;最后,用訓練好的LVQ網絡對大數(shù)據(jù)集進行二值化分類。
  基因的時間序列表達譜是一種非平穩(wěn)的信號,這種非平穩(wěn)的信號中含有大量信息。為了更好地挖掘基因表達譜中的信息,在第三章,我們先通過數(shù)據(jù)預處理和差異基因篩選找出表達差異大的相關基因;然后對這些表達差異大的相關基因的時間序列信號做

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論