基于GPU的分子動(dòng)力學(xué)勢(shì)函數(shù)及結(jié)構(gòu)特征量模擬系統(tǒng).pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、GPU(Graphics Processing Unit，圖形處理器）具有很強(qiáng)的并行計(jì)算能力，尤其 CUDA(Compute Unified Device Architecture，統(tǒng)一計(jì)算設(shè)備架構(gòu)）的出現(xiàn)使得GPU在高性能計(jì)算中占據(jù)越來越重要的地位。分子動(dòng)力學(xué)模擬技術(shù)是指利用計(jì)算機(jī)來模擬體系中各個(gè)粒子隨時(shí)間的運(yùn)動(dòng)變化情況，由于其計(jì)算量較大，因此考慮放到GPU上來執(zhí)行。
　　本文在分析了GPU的并行能力及分子動(dòng)力學(xué)模擬原理的基礎(chǔ)上

2、，將模擬計(jì)算過程中耗時(shí)最多的勢(shì)函數(shù)計(jì)算移至GPU計(jì)算，分析勢(shì)函數(shù)計(jì)算的內(nèi)在并行性，利用CUDA線程與粒子間的---對(duì)應(yīng)關(guān)系，并結(jié)合GPU自身特點(diǎn)，完成計(jì)算的加速。本文實(shí)現(xiàn)了兩種對(duì)勢(shì)（Morse勢(shì)、Lennard-Jones勢(shì)）和兩種多體勢(shì)（Tersoff勢(shì)、EAM勢(shì)）的GPU加速計(jì)算。計(jì)算結(jié)果表明，在NVIDIA GeForce GTX650的GPU上，相對(duì)于Intel Core2 E7500的CPU，勢(shì)函數(shù)計(jì)算的加速比在22-91之間

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