HLA-B27、PDCD-1、IL-23R基因多態(tài)性與強直性脊柱炎的相關(guān)性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、強直性脊柱炎(Ankylosing Spondylitis, AS)是一種與免疫相關(guān)的復(fù)雜疾病,受遺傳和環(huán)境等多種因素的共同影響。多個研究顯示遺傳因素在AS發(fā)病中起著十分重要的作用。
   位于6號染色體短臂上的人類主要組織相容性符合體 (major histocompatibility complex,MHC)是與AS相關(guān)的主要遺傳位點。MHCⅠ編碼的人類白細胞抗原B27 (human leukocyte antigen-B2

2、7,HLA-B27)是迄今所知的、與疾病相關(guān)中最強的HLA抗原。全基因組掃描發(fā)現(xiàn)除HLA-B27基因外,還有其他的非MHC基因參與AS的發(fā)病機制,由于AS屬于自身免疫性疾病范疇,一些和免疫相關(guān)基因與疾病的關(guān)聯(lián)性研究,已成為研究AS遺傳背景的一大亮點,例如白介素 (interleukin,IL)基因、程序性凋亡(programmed cell death,PDCD)基因等。然而受多種因素影響,造成這些研究結(jié)果并不完全一致,尤其是各種基因單

3、核苷酸多態(tài)性 (single nucleotide polymorphisms,SNP)與AS的關(guān)系尚未完全澄清,有待進一步研究。
   本課題首先采用聚合酶鏈反應(yīng)-序列特異性引物(polymerase chain reaction-se-quence-specific primer, PCR-SSP)法研究了中國湖北地區(qū)HLA-B27基因亞型與AS的相關(guān)性,然后再應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性 (polymera

4、se chain reaction-restriction fragment length polymorphisms,PCR-RFLP)技術(shù)對PDCD-1基因的3個SNP進行了AS疾病的關(guān)聯(lián)研究,最后,應(yīng)用meta分析探討了白介素-23受體(interleukin-23 receptor,IL-23R)基因中10個SNP與AS的相關(guān)性。本研究共分以下三部分:
   第一部分 HLA-B27基因亞型與強直性脊柱炎的易感性研究

5、r>   目的:分析在中國湖北地區(qū)HLA-B27基因亞型與AS的相關(guān)性,探討HLA-B27基因亞型在AS發(fā)病中的作用,同時評價HLA-B27基因亞型檢測的臨床意義。
   方法:收集HLA-B27陽性的研究對象共346例。其中AS患者190例,男129名,女61名,平均年齡(39±9)歲,健康對照者156名,來男81名,女75名,平均年齡(30±11)歲。采用病例對照研究方案,通過PCR-SSP進行HLA-B27基因亞型檢測。

6、
   結(jié)果:共檢出6種亞型,分別是B*2702、B*2703、B*2704、B*2705、B*2706及B*2713。在AS患者與健康對照組中,都以B*2704亞型(72.1%和56.4%)為主,其次為B*2705亞型(21.6%和31.4%),兩組中均檢測到頻率較低的B*2702亞型(0.5%和1.3%)及B*2703亞型(5.3%和8.3%),而B*2713亞型只在AS組測到1例(0.5%),B*2706亞型只在健康對照組

7、測到4例(2.6%)。AS患者組與健康對照組相比,盡管B*2703及B*2705亞型在對照組頻率較高,但兩組間的差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=1.301,P﹥0.05;χ2=4.032,P﹥0.05),OR值和95%可信區(qū)分別為為0.611和0.601,0.262-0.701和0.371-0.937。B*2704亞型在兩組中所占比例均為最高且組間存在顯著性差異(χ2=9.279,P﹤0.01),OR值為1.997,95%可信區(qū)為1.279-

8、3.119,顯示B*2704亞型與AS發(fā)病危險度相關(guān)。
   結(jié)論:中國湖北地區(qū)人群中B*2704和B*2705為主要亞型,其中B*2704與AS呈強相關(guān),B*2706可能與AS呈負相關(guān),其他低頻率基因亞型與AS的相關(guān)性有待進一步探討,HLA-B27基因亞型可作為AS早期診斷的重要參考指標。另外本研究所使用的PCR-SSP法能檢測出29個HLA-B27亞型(B*2701-B*2730,B*2722除外),能滿足當前對HLA-B2

9、7基因亞型檢測的需要。
   第二部分 PDCD-1基因多態(tài)性與強直性脊柱炎的關(guān)聯(lián)研究
   目的:分析PDCD-1基因SNP在AS患者與健康對照人群中的分布,比較兩組人群分布差異,探討PDCD-1基因多態(tài)性與AS易感性的關(guān)聯(lián),以期對深入研究AS的病因、發(fā)病機制提供一些理論依據(jù)。
   方法:采用病例對照研究方案,收集408名研究對象的血標本,其中包含216名AS患者標本。通過PCR-RFLP技術(shù)對PDCD-1基

10、因的3個SNP位點(rs11568821,rs2227981,rs2227982)進行分型,χ2檢驗比較患者組及對照組基因型和等位基因頻率的分布差異,運用SHESIS在線軟件進行LD和基因相關(guān)性分析。
   結(jié)果:位點一(rs11568821)在所有AS患者和健康對照組中僅發(fā)現(xiàn)GG純合子基因型,呈非多態(tài)性;位點二 (rs2227981)在AS患者和健康對照組中均檢出CC純合子、CT雜合子和TT純合子三種基因型,但在兩組中該位點基

11、因型和等位基因分布頻率相近,χ2檢驗差異無顯著性(P=0.145);位點三 (rs2227982)在AS患者和健康對照組中均檢出TT純合子、CT雜合子和CC純合子三種基因型,且基因型和等位基因分布頻率在兩組中具有顯著性差異(P=0.025),AS患者組具有更高的CT雜合子基因型(P=0.026, OR=1.542, 95% CI=1.051-2.261)和T等位基因的頻率(P=0.004, OR=1.553, 95% CI=1.144-

12、2.109)。運用SHESIS在線軟件分析rs2227981和rs2227982,發(fā)現(xiàn)兩者存在較強程度連鎖(D'=0.729);在該兩個位點構(gòu)建了4種單體型,CT單體型的頻率在AS患者組 (21.6%) 高于健康對照組 (13.9%) (P=0.002, OR=1.712, 95% CI=1.222-2.397),CC單體型在健康對照組 (57.1%) 比AS患者組(44.6%)更普遍(P=0.000, OR=0.603, 95% CI

13、=0.467-0.780)。
   結(jié)論:在中國漢族人群中, rs2227982中CT雜合子和T等位基因、特定單體型CT(PDCD-1.5/1.9)與AS發(fā)病呈正相關(guān),CC單體型與AS發(fā)病呈負相關(guān),PDCD-1基因多態(tài)性與AS之間存在遺傳相關(guān)性。PDCD-1基因多態(tài)性與AS的相關(guān)性還需在更大規(guī)模不同人群中研究,以便得到更多證據(jù)。
   第三部分 IL-23R基因多態(tài)性與強直性脊柱炎關(guān)聯(lián)研究的meta分析
   目

14、的:對國內(nèi)外有關(guān)IL-23R基因多態(tài)性與AS的研究結(jié)果作meta分析,綜合評價IL-23R基因SNP與AS的關(guān)系,為人群AS易感基因的評估提供依據(jù)。
   方法:電子檢索Medline數(shù)據(jù)庫和中國期刊全文數(shù)據(jù)庫,根據(jù)一定納入標準進行質(zhì)量評價以及數(shù)據(jù)提取,卡方檢驗各個研究之間的異質(zhì)性,采用Review Manager 4.2軟件進行統(tǒng)計分析。
   結(jié)果:共有6篇文獻符合納入標準,被研究的人群涉及9類,基因型頻率分布全部符

15、合Hardy-Weinberg遺傳平衡,Egger檢驗均未發(fā)現(xiàn)發(fā)表偏倚。共對10個IL-23R SNP位點(rs11209026,rs1004819,rs10489629,rs11465804,rs134315,rs10889677,rs11209032,rs1495965,rs7517847,rs2201841)等位基因的各項研究進行meta分析,齊性檢驗中除rs10889677外,均未發(fā)現(xiàn)異質(zhì)性(P>0.05),因此rs108896

16、77采用隨機效應(yīng)模型,其它位點采用固定效應(yīng)模型對等位基因頻率進行分析,綜合結(jié)果表明所有位點等位基因在兩組之間分布均存在差異(P<0.05),5個位點(rs11209026、rs10489629、rs11465804、rs1343151、rs7517847)等位基因在對照組分布頻率高于AS組,另5個位點反之。
   結(jié)論:IL-23R SNP與AS呈正相關(guān)或負相關(guān),被研究的10個等位基因中,與AS呈負相關(guān)性(對患者起保護作用)的位

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