

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領
文檔簡介
1、目的:根據(jù)2015年的最新癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明,胃癌(GC)在我國的發(fā)病率及死亡率均處于第二位。雖然近年來,我國在胃癌的診斷及治療上已經取得了巨大的進步,但大多數(shù)患者在確診時已處于晚期階段,失去了行根治性手術的機會,即便進行了手術,甚至術后的輔助放化療、靶向及生物治療等,患者的復發(fā)率及轉移風險仍很高,進展期胃癌患者的5年生存率僅為30%-50%,很可能是因為胃癌具有極強異質性,其分子信號通路復雜,許多癌基因和抑癌基因的失調被認為是導致胃癌形
2、成的不可或缺的因素。在過去數(shù)十年里,短鏈非編碼RNA,尤其是miRNAs的功能及作用機制得到了充分的闡明,而另一類興起的長鏈非編碼RNA(lncRNAs)近來被發(fā)現(xiàn)在包括胃癌在內的多種人類疾病中也發(fā)揮著重要功能。隨著芯片及測序技術的飛速發(fā)展,胃癌相關分子標志物得以不斷發(fā)掘。但大多數(shù)研究都著重于單個分子標志物,其用以胃癌診斷和預測的可靠性欠佳。因此,本課題利用Human LncRNA Microarray建立胃癌相關lncRNAs表達譜,
3、對有潛在研究價值的lncRNAs進行了初步驗證并對其臨床意義進行了探討,從而為后續(xù)完善胃癌相關的“分子標志群”,并基于胃癌分子標志群建立“胃癌相關lncRNAs診斷或預測模式”提供研究基礎。
方法:針對5個有明確胃癌家族史的胃癌患者,利用高通量基因芯片系統(tǒng)性地檢測了配對的癌及癌旁組織中l(wèi)ncRNAs和mRNAs的表達情況,建立了lncRNAs在胃癌中的差異表達譜。通過檢索文獻在表達譜中選出了3個可能有潛在功能的lncRNAs在
4、72對配對的胃癌及癌旁組織以及胃癌細胞株中運用qRT-PCR進行了驗證,并進一步對差異表達的mRNAs作了GO分析和Pathway分析。深入研究了上調的TUG1表達水平與胃癌患者臨床病理因素及預后的相關性,揭示其可能的臨床價值。
結果:我們通過lncRNA芯片篩選得到了胃癌癌及癌旁組織中差異表達的lncRNA共3107個,其中上調或下調超過2倍的lncRNA分別為1300個和1807個,上調或下調超過10倍的lncRNA分別有
5、50個和482個。結合文獻分析,選出了3個具有研究價值的LncRNAs:TUG1、HOTAIRM1、SNHG12,并分別在72對胃癌患者的配對組織以及胃癌細胞株中進行定量檢測, qRT-PCR結果與基因芯片的結果保持一致。對可靠的芯片結果中差異表達的mRNAs行GO分析顯示,有1898個上調mRNAs和1256個下調mRNAs富集于Biological Process;有1976個上調mRNAs和1349個下調mRNAs富集于Cellu
6、lar Component;有1846個上調mRNAs和1223個下調mRNAs富集于Molecular Function。此外,KEGG Pathway分析結果顯示:有47條信號通路與上調表達的mRNAs相關,12條信號通路與差異下調的mRNAs相關。相比于配對癌旁正常胃黏膜組織,lncRNA TUG1在腫瘤組織中的表達顯著上調,且與腫瘤浸潤深度(P=0.002)、淋巴結轉移(P=0.034)、遠處轉移(P=0.029)、TNM分期(
7、P=0.008)以及脈管內有無癌栓(P=0.045)有關。Cox分析亦顯示:TUG1的表達水平(P=0.031)與淋巴結轉移(P<0.001)、脈管內有癌栓形成(P<0.001)、遠處轉移(P=0.002)和TNM分期(P=0.039)共為影響胃癌患者OS的獨立危險因素。
結論:本研究通過 lncRNA芯片成功構建了胃癌 lncRNA差異表達譜,利用qRT-PCR選取部分LncRNAs進行初步驗證,證實芯片可靠。其中,TUG1
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
- 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
- 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 結直腸癌相關長鏈非編碼RNA的篩選與功能研究.pdf
- 賁門癌細胞凋亡相關長鏈非編碼RNA的分析.pdf
- 乳腺癌相關長鏈非編碼RNA初步驗證.pdf
- 基于組織表達譜的早期肺腺癌相關長鏈非編碼RNA的篩選與驗證.pdf
- 對基因芯片中篩選與骨肉瘤相關長鏈非編碼RNA的初步驗證.pdf
- 基于組織表達譜的結直腸癌相關長鏈非編碼RNA的篩選和驗證.pdf
- GSK3β相關長鏈非編碼RNA與重性抑郁障礙的相關性研究.pdf
- 白菜花粉發(fā)育和授粉受精相關長鏈非編碼RNA的鑒定方法.pdf
- 腫瘤相關長鏈非編碼RNA在血管內膜增生中的表達變化.pdf
- 基于一個肝癌相關長鏈非編碼RNA基因的克隆及序列分析研究.pdf
- 前列腺癌進展相關長鏈非編碼RNA的鑒定及其作用機制研究.pdf
- 小鼠著床前胚胎特異ERV相關長非編碼RNA的定向篩選及功能研究.pdf
- 影響棕色和白色脂肪分化相關長鏈非編碼RNA表達譜特征研究.pdf
- 增殖性玻璃體視網(wǎng)膜病變相關長鏈非編碼RNA的研究.pdf
- 豬早期胚胎發(fā)育相關長鏈非編碼RNA Lnc-370的功能研究.pdf
- 長鏈非編碼RNA(lncRNA)在胃癌中的表達譜分析.pdf
- 肺癌相關非編碼RNA的篩選及功能研究.pdf
- 重性抑郁障礙長鏈非編碼RNA的篩選及初步分析.pdf
- 拷貝數(shù)變異相關長鏈非編碼RNA對肝癌發(fā)生發(fā)展的影響及機制研究.pdf
- 長鏈非編碼RNA-H19與胃癌相關成纖維細胞活化的相關性研究.pdf
評論
0/150
提交評論