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文檔簡介
1、目的:總結骨性關節(jié)炎中醫(yī)現(xiàn)狀及基因組學研究進展,利用糖相關基因芯片技術比較骨性關節(jié)炎組與正常對照組之間外周血白細胞中糖基因轉錄水平的變化,研究骨性關節(jié)炎對外周血白細胞蛋白糖基化的影響,尋找與骨性關節(jié)炎相關的變化,探討骨性關節(jié)炎的分子機制,為骨性關節(jié)炎的檢測及治療提供幫助。
方法:選取15位骨性關節(jié)炎患者及15位健康志愿者,靜脈采血的方式抽取2.5ml外周血,制成外周血樣本保存,并將其分為骨性關節(jié)炎組和正常對照組。提取樣本RNA
2、,經定量后,檢測其完整性,熒光標記后與糖相關基因芯片雜交清洗。最后進行芯片掃描及數(shù)據(jù)的讀取與分析,篩選差異表達基因,進行實時熒光定量PCR驗證分析。
結果:提取的外周血白細胞RNA28S,及18S條帶完整,無明顯降解;38個差異表達基因中,骨性關節(jié)炎組上調表達的基因有18個,下調表達的基因有20個;基因芯片層聚類分析顯示,骨性關節(jié)炎組與正常對照組糖相關基因表達分布存在差異;RT-PCR結果顯示,糖相關基因芯片篩選出的6個差異表
3、達基因在10個骨性關節(jié)炎患者中表現(xiàn)出相同的差異表達趨勢;聚糖合成代謝通路分析顯示參與N-聚糖前體合成的DPM3和ALG8轉錄水平發(fā)生上調,GLB1和MAN2B1表達上調,O-聚糖合成方面,參與O聚糖Tn抗原(GalNAcα-Thr/Ser)合成的糖基轉移酶GALNT19和core2和core4結構合成的糖基轉移酶GCNT3表達同時上調,因此我們推測,O-聚糖core2和core4結構在骨性關節(jié)炎患者外周血白細胞中表達增加。
結
4、論:芯片數(shù)據(jù)經歸一化處理及分析,共篩選出38個差異表達基因,其中18個在骨性關節(jié)炎組中表達上調,20個在正常對照組中表達水平較高。應用實時定量RT-PCR對6個差異表達基因進行驗證,結果與芯片結果一致。通過對差異表達基因進行通路分析,骨關節(jié)炎外周血白細胞,硫酸化作用增高,糖鏈Galβ1-4GlcNAc降解作用增強,O-聚糖合成core2和core4結構增多,而這些變化可能與骨性關節(jié)炎造成的滑膜炎性物質釋放引起的免疫應答有關,從而導致關節(jié)
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