基于串聯質譜數據進行蛋白質序列庫搜索算法初探.pdf

1、蛋白質序列庫搜索方法為液相-串聯質譜聯用儀產生的高通量質譜數據提供了快速的分析方式，使生物樣品中的蛋白質可以得到快速定性定量分析。然而，該過程仍然存在很多問題。本論文初步研究了蛋白質序列庫搜索算法及對搜索結果進行分析的算法，并嘗試采用化學計量學方法對蛋白質庫搜索結果進行判別分析。 在第二章中，論文對當前廣泛采用的蛋白質序列庫，庫搜索算法及蛋白質定性方法進行了介紹。同時對由五種不同質譜儀產生的質譜數據的SEQUEST搜索結果，及

2、不同參數條件下的Mascot搜索結果進行對比，發(fā)現在不同條件下得到的結果相差較大，并且在所有的結果中存在大量的錯誤匹配。 為了對蛋白質序列庫搜索結果進行分析，并最大限度地消除錯誤結果的影響，大量的分析算法被開發(fā)出來，論文在第三章中對這些算法進行了介紹，并嘗試采用化學計量學中的模式識別方法對搜索結果進行判別分析，認為化學計量學方法可以明顯消除SEQUEST搜索結果中假陽性結果的影響。但對于Mascot搜索結果，這些方法無明顯提高