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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:本文旨在了解維生素D受體(Vitamin D Receptor, VDR)基因單核苷酸多態(tài)性( Single Nucleotide Polymorphism, SNP)與強(qiáng)直性脊柱炎( Ankylosing Spondylitis, AS)的遺傳易感性之間的關(guān)聯(lián)。
方法:采用病例對(duì)照研究的設(shè)計(jì)方法,從安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院風(fēng)濕免疫科收集620名符合1984年強(qiáng)直性脊柱炎修訂紐約標(biāo)準(zhǔn)的AS患者,同時(shí)按照頻數(shù)匹配的原則,在
2、合肥市中心血站收集年齡、性別、民族相匹配的620名無(wú)關(guān)聯(lián)的健康對(duì)照;選取VDR基因的4個(gè)候選位點(diǎn)FokI(rs2228570)、BsmI(rs1544410)、ApaI(rs7975232)以及TaqI(rs731236),采取改進(jìn)的多重連接酶檢測(cè)技術(shù)(iMLDR)進(jìn)行基因分型;構(gòu)建基因型、等位基因頻率、顯性、隱性、超顯性和純合子模型來(lái)分析上述選擇的4個(gè)SNP位點(diǎn)在病例與對(duì)照組之間的分布情況,同時(shí)對(duì)位點(diǎn)進(jìn)行連鎖不平衡(LD)檢測(cè)和單倍型
3、分析;最后分析 SNP位點(diǎn)基因型分布與AS患者疾病活動(dòng)度指數(shù)(BASDAI)以及疾病功能指數(shù)(BASFI)之間的關(guān)聯(lián)。由于AS發(fā)病存在性別差異,因此我們同時(shí)按照性別進(jìn)行了分層分析。符合正態(tài)分布的連續(xù)性資料統(tǒng)一使用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,而對(duì)于非正態(tài)分布的連續(xù)性資料則采用了中位數(shù)(四分位間距)表示;數(shù)據(jù)分析使用SPSS16.0軟件。檢驗(yàn)水準(zhǔn)設(shè)定為雙側(cè)0.05,多重比較使用Bonferroni法對(duì)P值進(jìn)行校正。
結(jié)果:AS患者平均年齡為
4、28.3±9.0歲,其中男性患者515(83.1%)人,女性患者105(16.9%)人;健康對(duì)照平均年齡27.8±7.6歲,男性512(82.6%)人,女性108(17.4%)人;病例與對(duì)照組在年齡(t=0.957, P=0.339)與性別(χ2=0.051, P=0.821)上均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。AS患者HLA-B27陽(yáng)性率為93.9%,病程為2.00(6.00)年,BASDAI得分為1.77(2.90),BASFI得分為0.90(2.3
5、5)。DNA樣本有1235例被成功分型,分型成功率為99.6%;遺傳平衡檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)在對(duì)照組中除FokI(rs2228570)外(P=0.002),其余各位點(diǎn)均達(dá)到了哈迪-溫伯格遺傳平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium, HWE)。不同遺傳模型分析后的結(jié)果顯示:病例與對(duì)照組的TaqI(rs731236)多態(tài)性在基因型(χ2=6.845, P=0.018)、等位基因頻率(χ2=6.705, OR[95%CI]=1.624
6、[1.122-2.352], P=0.006)、顯性模型(χ2=6.728, OR[95%CI]=1.656[1.128-2.431], P=0.010)與超顯性模型(χ2=6.476, OR[95%CI]=0.606[0.411-0.894], P=0.012)方面差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,經(jīng)過(guò)Bonferroni法校正后,在等位基因頻率、顯性模型及超顯性模型中的差異仍然有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.0125);而按性別進(jìn)行分層分析后,我們發(fā)現(xiàn)僅在
7、男性AS患者與男性健康對(duì)照間顯性模型分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,而在女性AS患者與女性健康對(duì)照中,這種差異并不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。連鎖不平衡檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)TaqI(rs731236)與BsmI(rs1544410)間存在較強(qiáng)連鎖(D’=0.87, r2=0.70),對(duì)二者進(jìn)行單倍型分析后發(fā)現(xiàn)了 TaqI-BsmI組成的兩種單倍型在病例與對(duì)照間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(H1:OR[95%CI]=0.671[0.473-0.952], P=0.022;H2:OR[9
8、5%CI]=1.516[1.012-2.270], P=0.042)。臨床特征分析發(fā)現(xiàn)AS患者功能指數(shù)得分BASFI在FokI(rs2228570)位點(diǎn)的三種基因型之間的分布具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(χ2=12.025, P=0.002),而在其余三個(gè)位點(diǎn)中未發(fā)現(xiàn)這種分布差異;此外按性別進(jìn)行分層分析后也發(fā)現(xiàn)只有男性AS患者BASFI得分會(huì)受到FokI(rs2228570)位點(diǎn)三種基因型的影響(χ2=9.825, P=0.007),而在女性AS患者
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