基于模型的蛋白質芯片數據分析.pdf

1、大部分的有機體特別是人類的巨大基因組非常復雜,但是經過轉錄修改后的蛋白質水平是更加復雜,比如磷酸化作用,乙酰化作用,遍在蛋白化作用,這些作用能夠很明顯地影響蛋白質的功能。因此,有必要對蛋白質的濃度和它們的變更性做深入的研究,從而能夠對生物系統(tǒng)做出更加深,入的理解。已知有蛋白質芯片上測出的各個樣本和它們自身成功稀釋的灰度水平,基于這些數據,現已有四種方法,建立不同的模型,得出灰度水平和真正的蛋白質濃度之間的相互關系。前三種方法分別是:線性

2、的(2005年由CristianMkcean提出),非線性的(2006年由Ioan Tabus提出),非參的(2007年由JianhuaHu提出)。它們都是要建立一種灰度水平和蛋白質表達之間的曲線關系,只是曲線的類型有所不同。最后一種方法是Serial dilution curve(2009年由Lizhang提出),雖然它也是在找灰度水平和蛋白質濃度之間的曲線關系,但是具體的思想和前面的都有所不同,這在本文中將會詳細介紹。這四種方法各有